本文通过对跨国公司在华R&D投资与中国国家创新系统的作用机理分析，认为跨国公司R&D机构具有跨国公司母国与东道国国家创新系统组分的双重性质，是连通跨国公司母国与我国国家创新系统的桥梁和纽带，对我国国家创新系统在补充系统组分，优化系统结构和功能等方面有着重要的促进作用，其知识外溢效应有助于我国技术水平的提高和管理、制度知识的积累。但是，过分依赖跨国公司在华R&D也会造成一系列的负面影响，需要有针对性的加以解决。